A játék alakult ki egy titkos laboratóriumban alján található az óceán. Itt a magányban élt excentrikus tudós, tapasztalatok és kísérletek kollégái hibáztatom. Fő feladata az volt, hogy hozzon létre egy élőlény felruházva ok és évekkel később, hogy ő tette. De ugyanakkor a teremtő rejtélyes körülmények között eltűnt, így Goo (ezt a nevet kapta utódai), és várni rá, hogy hiányzik. Hero fáradt lóg ki egy lombikban-kamera és kap belőle, ment egy túra a komplex találni nyomát a hiányzó barátja. Az a képesség, hogy válassza ki a bizonyos fokú rugalmasságot segít leküzdeni a különböző akadályokat, hogy megbirkózzon az ellenséget, és behatolni, ahol a hétköznapi ember, vagy hogyan nem kap.